Sacha et Pikachu voyagent seuls, visitant de nouveaux lieux et rencontrant différents Pokémon, et leurs découvertes les remplissent de joie ! Chen et Delia approuvent, eux aussi. Plus jeune, le professeur aimait se promener et découvrir de nouvelles choses, et Delia est impressionnée par l'objectif de son fils : se faire plus d'amis Pokémon. Alors que Team Rocket complote pour voler Pikachu, Sacha rencontre le Pokémon légendaire Latias, gravement blessé ! Notre héros lui administre les premiers soins, mais Latias reste prudent. Le lendemain, la Team Rocket capture Latias, mais Sacha et Pikachu contrecarrent leur plan, et le trio s'envole vers d'autres cieux. Tandis que Latias s'en va, Sacha se demande s'il le reverra un jour...